På tross av at linefiske er en selektiv og skånsom fiskemetode, byr den på betydelige utfordringer knyttet til lokalisering, tap av redskap og miljøpåvirkning. Lange liner settes ofte på store dyp og i krevende bunnforhold, særlig i blåkveitefisket, hvor strøm, vær og bunntopografi øker risikoen for at liner flytter på seg, henger seg fast, eller går tapt. Tapte liner fører til spøkelsesfiske, økonomiske tap for fiskerne og omfattende oppryddingsarbeid, slik Fiskeridirektoratets ryddetokt tydelig viser.